在過去的幾十年中，熒光顯微鏡已成為一個研究生物分子，途徑和在活細胞，組織和整體動物動力學的各種各樣的必不可少的工具。相反）其他技術（如電子顯微鏡，熒光成像是與正在保持文化，使一個大跨度的時間尺度上發生的事件微創光學觀察細胞兼容。在空間分辨率方面，包括正電子發射斷層掃描，磁共振成像和光學相干斷層掃描技術，可以產生動物和人類受試者在10厘米和10微米之間的決議的圖像，而電子顯微鏡和掃描探針技術具有較高空間決議，往往接近分子和原子水平。這兩個極端之間在解決權力在于光學顯微鏡。除了能夠形象的活細胞，熒光顯微鏡的所有形式（包括廣角，激光掃描，旋轉盤，多光子，和全內反射的較顯著的缺點）所帶來的好處是空間分辨率的限制。